关于此问题的bug report建议遵循完整的升级路径，并且对我有用。遇到此错误后，我能够恢复到旧版本，然后正确升级。

特别是：一次只升级一个主要版本，并仔细检查先决条件和升级步骤。其中最重要的部分是检查您与db.adminCommand( { getParameter: 1,featureCompatibilityVersion: 1 } )的兼容性，并确保它与当前版本匹配，然后再升级到下一个版本。使用db.adminCommand( { setFeatureCompatibilityVersion: "3.6" } )

在https://docs.mongodb.com/manual/release-notes/3.6/#upgrade-procedures https://docs.mongodb.com/manual/release-notes/4.0/#upgrade-procedures等页面上阅读完整的文档

我在Mac OS上使用Homebrew将MongoDB从3.6升级到4.2，并遇到了类似情况。

由于公式mongodb已从自制软件核心中删除，因此mongodb团队维护了custom Homebrew tap。

以下是我使用Homebrew将MongoDB从3.6升级到4.2的解决方案：

1. 从Homebrew卸载旧版本的mongodb

# If you run mongodb in background service,stop it first.
brew services stop mongodb
# If you have multiple version of mongodb,you might need to add `--force` option for deleting all of them at once.
brew uninstall mongodb

1. 从自定义Homebrew水龙头安装新的mongodb

brew tap mongodb/brew
brew install mongodb-community@3.6

1. 将mongodb-community@3.6添加到您的PATH

echo 'export PATH="/usr/local/opt/mongodb-community@3.6/bin:$PATH"' >> ~/.bash_profile

1. 重新启动终端，然后运行mongod

2. 打开另一个标签或终端窗口以运行mongodump

3. 终止mongod

4. 卸载mongodb-community@3.6，然后重新安装mongodb-community

brew uninstall mongodb-community@3.6
brew install mongodb-community

1. 使用旧的mongo数据结构删除旧数据

rm -rf /data/db/*

1. 运行mongod

2. 打开另一个标签或终端窗口以运行mongorestore dump/

mongorestore完成后，mongod将终止。 您可以将mongodb作为后台服务运行，也可以再次运行mongod。使用mongo或Robo 3T（以前称为Robomongo）打开MongoDB，您会看到数据像往常一样好。

希望有帮助。

经过大约3个小时的尝试完全解决您所描述的问题，这就是我采取的步骤。在这里，我将展示如何在降级到3.6的同时保留数据，以及如何使用保留的数据将其更新为4.0。

对于Mac用户来说，发生这种情况的原因是因为使用brew的人有一个更新，无法再直接从brew下载Mongodb。然后人们倾向于从brew下载而不是较新的社区版本，然后该版本与仍然存在于目录中的3.6 db文件夹的旧版本发生冲突。相反，您需要从实际的mongodb网站下载它：

https://www.mongodb.com/download-center/community

在这里，您要手动下载所有内容。请按照此处的说明进行操作，但请使用3.6版本：

https://medium.com/@saurabhkumar_4718/install-mongodb-without-homebrew-on-mac-os-2a98b68ab09c

注意：复制.bash_profile时，请确保export命令不是

一旦您成功手动安装了3.6版本，就可以mongodump进行安全保护，或者使用mongoexport将所有mongo数据导出到json中，以获取您真正需要保存的所有数据。

之后，您可以按照与以前对3.6完全相同的步骤，重新手动重新安装4.0

这对我有用，而无需执行任何“ mongorestore”，因为“ db”文件夹被单独放置了，我的所有数据都在那里，但是也许需要额外的步骤来还原数据。最糟糕的是，您有需要重写的.jsons。 'mongo --version'也显示了正确的版本：)希望对您有帮助

• 备份所有数据库（使用 mongodump ）
• 由于/ data / db中的每个文件与较新版本不兼容，因此删除它们： rm -rf / data / db / *
• 通过 mongod
重新启动MongoDB服务
• 还原所有数据库（使用 mongorestore ）

https://dba.stackexchange.com/a/252393

对于 Docker：

我在将使用 Docker 的项目从 3.6 升级到 4.2（和 4.4）时遇到了这个问题。

项目的设置方式意味着我没有要清除的物理 /data/db 目录。

但是，定义了一个卷作为 /data/db 目录。

在这种情况下，您需要做的就是备份您需要的任何数据并删除关联的卷。

如果将 vs 代码与 docker 扩展一起使用，您只需在侧栏中打开 docker 选项卡，展开卷部分，找到有问题的卷（对我来说，它被称为 mongo-4-2-upgrade-test_mongo-data，这取决于您的各种容器以您的项目命名），右键单击并删除。

确保使用此卷的容器已正确关闭，否则您将收到 409 conflict 错误。我做了与上面相同的操作，但找到了我的 mongo 容器（在 docker 选项卡的容器部分）。然后当我重新启动我的 docker-compose 文件时，新版本的 mongo 已安装并按预期运行。