我试图在R脚本中执行python脚本,并在其中加载pysam
包:
tmp.py
#!/usr/bin/env python
import pysam
print("pysam loaded")
tmp.R
#!/usr/bin/env Rscript
system("python ~/tmp.py")
现在,如果我使用Rscript tmp.R
在控制台中运行此RScript,它将起作用;但是如果我在RStudio控制台中运行它,则会收到错误消息,表明pysam无法加载。
有什么想法吗?