我正在尝试安装名为prokka(http://www.vicbioinformatics.com/software.prokka.shtml)的软件 但是我安装时出错。
我尝试通过git hub clone指示进行安装: 并得到了这个:
无法在@INC中找到XML / Simple.pm(您可能需要安装XML :: Simple模块)(@ INC包含:/home/paulo/anaconda3/lib/site_perl/5.26.2/x86_64- linux-thread-multi /home/paulo/anaconda3/lib/site_perl/5.26.2 /home/paulo/anaconda3/lib/5.26.2/x86_64-linux-thread-multi /home/paulo/anaconda3/lib/5.26。 2。)在/ home / paulo / prokka / bin / prokka第29行。 BEGIN失败-在/ home / paulo / prokka / bin / prokka第29行中,编译中止。
我尝试通过以下方式安装XML:
sudo cpan install
但没有成功。
我还按照要求依次安装了所有其他依赖项,但似乎不起作用。
然后我尝试使用conda并得到了它:
错误conda.core.link:_execute(700):发生错误 安装包'bioconda :: perl-algorithm-diff-1.1903-pl526_2'。 回滚事务:完成[Errno 13]权限被拒绝: '/home/paulo/anaconda3/lib/site_perl/5.26.2/Algorithm'()
现在我不知道该怎么办。
有帮助吗?
谢谢您的时间。
Paulo