在NodeJS中运行Conda命令

2024-05-08 • 问答

我无法在NodeJS应用中使用exec运行Conda命令。

var conda_path = '~/miniconda3/bin/conda'

var cmd = conda_path + ' init bash & ' + conda_path + ' activate XYZ'
exec(command,function(error,stdout,stderr){

    }
);

我收到以下错误：

/ bin / sh：/ Users / username / Desktop / repos / project / XYZ：是目录

CommandNotFoundError：您的外壳尚未正确配置为   使用“ conda激活”。要初始化外壳，请运行
$ conda init <SHELL_NAME>
当前支持的shell是：     -重击     -鱼     -tcsh     -xonsh     -zsh     -Powershell

有关更多信息和选项，请参见“ conda init --help”。

重要提示：您可能需要在运行后关闭并重新启动Shell   'conda init'。

我在网上找不到有关从NodeJS应用程序运行conda命令的相关信息。

我该如何做？

t似乎可以使用&字符来运行多个命令。

我还需要指定位于conda.sh内部的/users/username/miniconda??/etc/profile.d/的路径。

此文件可以复制到任何位置，例如NodeJS应用程序的根文件夹。

这是工作代码：

Windows 10

var commands = [
        'C:\\anaconda\\Scripts\\activate.bat C:\\anaconda','conda activate XYZ_v0_1_env','XYZ arg1  <some_file_input> arg2 arg3 arg4 <some_file_output>',]

exec(commands.join(' & '),function(error,stdout,stderr){
        console.log(error)
        console.log(stdout)
        console.log(stderr)
    }
);

OSX

const exec = require('child_process').exec;

var conda_path = __dirname + '/conda.sh'

var commands = [
        conda_path,conda_path + ' init',conda_path + ' activate XYZ_v0_1_env',stderr){
        console.log(error)
        console.log(stdout)
        console.log(stderr)
    }
);

编辑：使用spawn而非exec来读取流程的实时输出，即生成实时进度：

var commands = [
        'C:\\anaconda\\Scripts\\activate.bat C:\\anaconda',]

var spawn_ = spawn(commands.join('&'),{ shell: true });

spawn_.stdout.on('data',function (data) {
    //do something
});

spawn_.stderr.on('data',function (data) {
    //do something
});

spawn_.on('exit',function (code) {
    //do something
});

`conda run`

Conda提供了conda run命令，用于在环境中执行程序或运行脚本，而无需手动激活它。在您的情况下，您只需要一个命令即可，例如

var conda_exec = "C:\\anaconda\\Scripts\\conda.exe"
var env_name = "XYZ"
var sub_cmd = "XYZ arg1 <some_file_input> arg2 arg3 arg4 <some_file_output>"

var command = [conda_exec,'run','-n',env_name,sub_cmd].join(" ")

...

请注意，conda run当前直到最后才返回I / O结果。这意味着您将无法测量正在执行的命令的进度，并且如果期望获得较大的回报（即内存不足），则不应使用此命令。

建议：考虑命名环境XYZ_env或什至包括版本控制（例如XYZ_v0_1_env），以便区分环境XYZ和{{1 }}程序。

在NodeJS中运行Conda命令

owen7758 回答：在NodeJS中运行Conda命令

conda run

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