我最近将MacOSX系统升级到了Catalina，并且几个文件被自动放置到桌面上的“ Relocated items”文件夹中。我最近尝试运行以下以前有效的代码：

qualimap bamqc -bam Sample1_sorted.bam -c -outdir QualiMap/Sample1_sorted

并收到以下错误：

Java HotSpot(TM) 64-Bit Server VM warning: Ignoring option MaxPermSize; support was removed in 8.0
Error: Unable to initialize main class org.bioinfo.ngs.qc.qualimap.main.NgsSmartMain
Caused by: java.lang.NoClassDefFoundError: org/apache/commons/cli/ParseException

我已经看到许多其他与此错误有关的posts，但不确定如何尝试一些建议的解决方案。我不直接使用这些论坛中提到的某些应用程序/文件，例如JAVA，Maven，AppAssembler和pom.xml文件（我什至找不到该文件）。因此，我希望从使用qualimap的生物学家的角度来问这个错误。

如何解决此错误（对上述应用程序/文件了解很少）？我当然可以使用这些应用程序/文件，但是我可能需要有关如何访问和修改它们的更详细/基本/低级的建议。谢谢！