计算R中矩阵各列之间的相关性

我在R中具有以下矩阵mat

      x  y  z
rowA -1  1  2
rowB -1 -2 -1
rowC  2  1 -1

如何计算矩阵各列之间的相关性(例如corr(x,y)corr(y,z)corr(x,z)),而不是将各列分成向量?

如果人们能抽出时间来解释这一点,我将不胜感激。

gao1046811914 回答:计算R中矩阵各列之间的相关性

您可以这样做:

#gives pairwise
COR = cor(M)
# to get 1 vs 2,1 vs 3 and 2 vs 3
COR[upper.tri(COR)]
,

我们可以使用combn创建一次取2的列名称组合,从矩阵中组合该组合,然后计算它们之间的相关性。

combn(colnames(mat),2,function(x) cor(mat[,x[1]],mat[,x[2]]))
#[1]  0.5 -0.5  0.5

数据

mat <- structure(c(-1L,-1L,2L,1L,-2L,-1L),.Dim = c(3L,3L),.Dimnames = list(c("rowA","rowB","rowC"),c("x","y","z")))
,

基本R:

cor_df <- data.frame(vars = row.names(cor(mat)),cor(mat),row.names = NULL)
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