我需要从各个基因组序列数据中得出一个简短的串联重复序列（STR）。我正在尝试使用BioPython。当我搜索任何STR等位基因或序列时，我想知道该序列在FASTA文件中的位置（该序列所在的染色体编号，以及该序列开始和结束的碱基对位置），但是我不清楚该怎么做。使用BioPython。有人告诉我FASTA文件不包含染色体信息，那么我还能做什么？我也尝试过CRAM / BAM文件，但是BioPython不接受这些文件。我只想打印该FASTA文件的每个序列的位置。
我该怎么做？
SAGILL 回答：使用Biopython的Fasta文件中序列的染色体位置
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