Platanus_allee基因组组装者组装错误失败

我正在尝试运行Platanus_allee基因组组装程序来组装基因组。但是,当我运行阶段命令时,它会出现以下错误:

我的命令:

  

bio @ bio-XPS-8700:〜/ Fareeha / Platanus / Platanus_allee_v2.0.2_Linux_x86_64 $ ./platanus_allee阶段-c out_contig.fa out_junctionKmer.fa \ platanus_allee阶段\ -c out_contig.fa out_junction1 Ker.fa \ -IP home / bio / Fareeha / test / SMIX_test_data / Unzip / SDNA-270_1_head-3000000.fq /home/bio/Fareeha/test/SMIX_test_data/Unzip/SDNA-270_2_head-3000000.fq \ 2> phase.log

输出:

platanus_allee版本:2.0.2

./ platanus_allee阶段-c out_contig.fa out_junctionKmer.fa platanus_allee阶段-c out_contig.fa out_junctionKmer.fa -IP1 /home/bio/Fareeha/test/SMIX_test_data/Unzip/SDNA-270_1_head-3000000.fq / home / bio / Fareeha / test / SMIX_test_data / Unzip / SDNA-270_2_head-3000000.fq 2

Error(13): Error,SolveDBG exception!! 
platanus_allee solve_DBG command failed.

有人可以帮我解决吗?

jjyinhua 回答:Platanus_allee基因组组装者组装错误失败

在platanus2的阶段,我通过安装带有conda的minimap2来解决了该问题,一切正常。

conda install -c bioconda minimap2
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